El objetivo del BIP consiste en apoyar proyectos (se utilizarán como sinónimos los términos “iniciativas” y “propuestas”) formulados por los pueblos indígenas y/o sus Organizaciones representativas destinados a, primero, mejorar la administración de la justicia propia, segundo, consolidar la coordinación entre la Jurisdicción Especial Indígena (JEI) y la justicia ordinaria, y/o tercero, proteger los derechos de la mujer, la juventud, la niñez y los mayores dentro de los sistemas de justicia propia indígena. De esta manera, los pueblos indígenas y/o organizaciones representativas podrán proyectar estrategias y acciones a partir del conocimiento propio de sus fortalezas y oportunidades de mejora en materia de justicia. Además, el Banco servirá de instrumento al Ministerio de Justicia para conocer, recopilar y registrar tales estrategias y acciones
